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2023-09-19 15:19

VA生物银行是美国黑人基因数据的最大来源

在2020年大流行初期,范德比尔特大学医学中心(Vanderbilt University Medical Center)治疗患者的肾脏病学副教授阿德里安娜·洪(Adriana Hung)注意到,因冠状病毒住院的黑人患者死于急性肾衰竭的比例不成比例。

为了验证她的理论,即病毒可能激活了APOL1基因的两个突变——大约八分之一的非洲裔人中发现了一种基因变异的组合——洪求助于百万退伍军人计划(MVP),这是一个联邦政府资助的基因生物银行,也是美国黑人基因数据的最大单一来源。她很快得到了确认。

“全世界都在试图了解发生了什么,但他们没有这种资源,”洪说。他的研究结果发表在1月份的《美国医学会内科杂志》(JAMA Internal Medicine)上。

MVP是由退伍军人事务部运营的,拥有超过15万美国黑人的数据,对她的发现至关重要。现在,由于Hung的预感和数据库的速度和覆盖范围,一家制药公司即将向美国食品和药物管理局申请一种针对APOL1的新药的批准;长期以来在医学研究中代表性不足的非裔美国人也得到了一些早该得到的有益关注。

众包的线索

MVP成立于2011年,目前已有90.3万名贡献者,明年有望达到百万会员的目标。

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在自愿项目中,退伍军人提供血液样本进行DNA检测,允许查阅他们的保密医疗记录,并填写偶尔的调查以收集信息,包括他们的家庭病史、在军队中接触有毒化学物质、睡眠和运动习惯以及情绪。

MVP主任Sumitra Muralidhar说,广泛的目标是加快“个性化医疗”的发展,或个性化和预防性健康战略。“我一想到这个就起鸡皮疙瘩,”她补充说。“我们正在取得进展。”

“MVP可能是世界上最有用的生物样本库,”耶鲁大学医学院(Yale School of Medicine)精神病学教授乔尔·格勒恩特(Joel Gelernter)说。格勒恩特与其他研究人员合作发表了十几篇基于MVP的论文,其中包括最近一项关于创伤后应激障碍和抑郁症的生物学基础的研究。他说,生物库对调查创伤后应激障碍和滥用阿片类药物和酒精等物质特别有帮助,这两种情况对退伍军人的影响都大于平民。

生物银行的繁荣

2003年人类基因组计划完成后,基因研究的爆炸式增长激发了几个类似的项目。

美国国立卫生研究院于2018年启动的“我们所有人”项目也邀请了100万美国人帮助建立一个生物银行。到目前为止,它已经收集了超过37.4万名参与者的血液、唾液或尿液样本,并获得了医疗记录和可穿戴设备上的数据,其中近一半的人属于历史上代表性不足的种族或族裔群体。英国生物银行成立于2006年,已经收集了50万受试者的数据。其他大型项目包括范德比尔特大学的BioVU和芬兰的FinnGen。

Muralidhar说,MVP不仅是最大的生物库,也是代表性最多样化的生物库。

该项目发展如此之快,部分原因在于VA的内部覆盖范围,有100多家诊所参与其中。Muralidhar说,另一个优点是参与者的利他主义。

她说:“在启动这个项目之前,我们对退伍军人进行了调查,70%的人表示,如果被要求,他们会参加。”“他们不期待任何回报,他们一遍又一遍地说的关键是‘这能帮助到另一名老兵吗?如果有,我就加入。’”

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67岁的西尔维斯特·诺曼(Sylvester Norman)是纳什维尔的一名海岸警卫队老兵和退休日托员,他说,大约两年前第一次听说这个项目时,他很高兴能加入。诺曼是四兄弟中的老大,他们都患有肾病。其中两人死亡,另一人接受了两个肾脏移植。

“在这个阶段,这对我没有好处,但我的天哪,这对我身后的人有好处,因为我知道我正在经历什么,”他说。

发现的宝库

主要期刊发表了一系列基于MVP数据的研究,其中有几项研究声称是同类研究中规模最大的。

2021年5月发表在《自然神经科学》(Nature Neuroscience)上的一项关于抑郁症遗传性质的研究涉及100多万参与者,其中包括30万MVP受试者,Gelernter和其他研究人员发现了几个可能增加抑郁症风险的新基因变异。

8月发表在《自然医学》(Nature Medicine)杂志上的一项关于冠状动脉疾病(CAD)遗传风险的研究,利用了MVP中40多万参与者的数据,发现白人、东亚人、非洲人和美洲原住民患冠心病的风险似乎是一样的。

6月份发表的另一项基于mvp的研究将127种疾病与身高相关的基因联系起来,其中大部分结果适用于黑人和白人。研究发现,个子高的人患高血压和心脏病的风险较低,但患心房纤颤和一些循环系统疾病的风险也较高。另一项涉及19万多名退伍军人的研究项目发现,喝酸奶对心脏有好处。

穆拉利达尔说,她不打算在登记了第100万名退伍军人后停止,尽管她可能需要为这个项目取一个新名字。展望未来,她说她希望把重点放在扩大参与者的范围上,包括更多的女性——目前在生物库中只有不到10%的女性,部分原因是女性在军队中的代表性不足——以及研究人员较少关注的疾病。

“我们比以往任何时候都更了解某些医疗条件,我们希望继续前进,”穆拉利达尔说。